1、無法辦理房屋產權證：產權證是房屋的物權證明，不動產無法取得產權證，也就是說不能獲得不動產的完整物權，也就不能進行合法轉讓、抵押房屋收益。
2、過戶登記費用高：回遷戶可以享受一些政策的優惠，但是回遷房過戶交易的時候就可能面臨補交一些費用的情況，這樣就增加了過戶登記費用的支出。
3、存在一房多賣風險及違約風險：在房價上漲的時候，出賣人違約主張合同無效或合同解除的風險是極大的，因此是很容易發生法律糾紛的。
4、存在安全隱患：有不少回遷房在物業、衛生、供暖、消防，甚至戶籍遷入方面都存在各種隱患和問題。
回遷房是發展商徵收土地的時候賠償給回遷民的房子，隨著舊城的改造不斷深入，獲得回遷房的拆遷戶不斷增多，隨之回遷房交易也較為常見。
其實基本上每個樓盤都會有一定量的回遷房，由於回遷房具有補償性質，享受國家政策的優惠，是不含土地轉讓金的，因此價格相對較低。這也是很多人考慮買回遷房的一個重要原因，但購買回遷房會面臨更名等問題，稍不留意便會引發產權糾紛。
1、房子的性質不同
回遷房和商品房是同一個拆遷區，但兩者的性質不同。
回遷房不是商品房，而是集體土地的房子，屬於集體所有，地塊性質也通常是分配收入，不需要支付土地轉讓金，是特定人群使用的，所以價格便宜。但是，如果需要辦理戶口手續，就需要支付土地轉讓金。
商品房主要經政府有關部門批准，由市場經濟下的地產開發商獨立運營，可以向所有購房者公開銷售，自由交易。另外，房主擁有房屋的完整產權，不限於任何人和機構。
2、房價的差異
回遷住宅享受國家政策優惠，是補償購買，住宅價格也是政府部門參考實際情況確定後確定報價，在執行過程中受到政府的嚴格管理。因此，價格上回遷房比普通商品房好。
商品房的價格更大程度上是市場波動的結果，不僅受區劃本身區域位置的影響，還受經濟發展、市場行情和供求矛盾等影響，上升空間非常大。
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