1、時間不同。網籤是在開發商已經取得了預售證，且購房者也滿足購房資格，完成選房，簽訂合同之後，在售樓部或者在房屋管理部門完成的。現在有一部分開發商會在未取得預售證或其他證明時，就與購房者簽訂相關的協議或者合同，這樣的情況是沒辦法進行網籤的。另外，如果購房者自身的購房資格沒有被核驗通過，也不能進行網籤。備案是在簽約之日起30日內持商品房預售合同向縣級以上房地產管理部門和土地管理部門辦理登記備案手續。一般來說，網簽在前，備案在後，備案以網籤為前提，只有備案後房屋買賣才算是正式生效。
2、辦理流程不同。網籤流程：選定網籤時間——準備網籤資料——確認網籤條款——完成網籤。備案流程：合同備案——稽核——取得備案號——打印合同文本——雙方簽字蓋章——完成備案。備案是在網簽完成之後進行的，最終經房地產管理部門的稽核會返回一個備案號，此備案號是唯一的，在網上輸入備案號可以查詢房屋的相關資訊。
1、買賣雙方要協商合同的相關條款內容。
2、操作人員登入存量房(二手房)網上籤約系統從已公示房屋資訊中選取所交易房屋，線上填寫買賣合同的有關內容，並填寫《存量房交易結算資金劃轉協議》或《存量房交易結算資金自行劃轉宣告》。填寫完成後由買賣雙方自行設定合同查詢密碼，操作人員進行網上提交。
3、買賣當事人和房地產經紀機構簽訂的房地產經紀合同須作為《存量房買賣合同》的附件一併提交到系統中。在合同提交完畢後，操作人員從系統中聯機列印《存量房買賣合同》，還有《存量房交易結算資金劃轉協議》或《存量房交易結算資金自行劃轉宣告》。
4、合同提交後可從網上列印《轉移登記申請表》，當事人進行簽字蓋章後，可持申請表及其他相關材料到房屋權屬登記部門辦轉移登記手續。
目前樓市銷售的商品房多為期房，有的房子還沒有破土動工，就已開始內部預約銷售。購房者雖然和開發商簽訂了購房合同，但是合同能否順利執行很難保證，比如有的開發商因為開發手續不全，不能及時辦理產權證，有的則暗中被開發商二次抵押，一房二主，產權被別人分割等。因此為了對開發商進行有效的制約，就實行了購房合同備案制度。購房合同備案不僅能促使開發商加快建房，按章辦理產權證，也可使購房者更加放心，很好地規避了一房二主為消費者帶來的諸多隱患。
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