微生物肥料沒有任何殘留

微生物肥料是生物製品，生產微生物肥料的原料也是農副產品和天然的物質。用於農田的微生物肥料中的菌株都是來自於自然界，並且是用科學的方法選出的，對人畜禽植物都沒有致病性的微生物。微生物肥料產品中的載體大多選自無公害的農副產品，經過發酵腐熟施入土壤中會全部降解，沒有任何殘留。

微生物肥料是有利於大自然良性物質迴圈的可持續發展的肥料，微生物肥料具有提供或活化養分功能、產生促進作物生長活性物質能力、促進有機物料腐熟功能、改善農產品品質功能、增強作物抗逆性功能、改良和修復土壤功能6方面的功能。微生物肥料完全可以用於有機農產品種植。

作為微生物肥料主體的各種菌體在田間發揮作用後，特別是在作物採收後，大部分都死亡降解。這也是微生物肥料並不是一施永益，應該連年使用的原因。有機農產品種植對環境、土、肥、水，乃至風向都有一定要求。有機農產品論證部門也贊成使用微生物肥料。