滅菌程度差異；微生物指標不同；滅菌環境不同；用途不同。口罩上的“滅菌”指的並不是消毒滅菌，而是環氧乙烷滅菌，即EO滅菌。
正規廠家生產的合格醫用口罩都屬於二類醫療器械。
無論是滅菌型醫用口罩還是非滅菌型醫用口罩，它們所有的生產流程都必須在10萬級的無塵車間進行的，其它指標如過濾效率或者氣流阻力等指標都是同樣要求，這一切按國家標準要求執行。而環氧乙烷滅菌指的是：在成品出來之後，再新增一道滅菌工序。滅菌級口罩在出廠之前都是進行嚴格的消毒殺菌處理的，上面不含有任何細菌和其它物質，衛生性和安全性比較高，防護功能更好。非滅菌級口罩一般是經過環氧乙烷滅菌的，雖然沒有滅菌級殺菌那麼徹底，但是也能起到一定的防護作用。
滅菌型口罩在製作的時候需要達到的要求是無菌，而非滅菌型口罩在製作的時候只對微生物有一定的限制要求。滅菌型口罩製作的時候全車間都會進行紫外線滅菌，並且還有定點監測裝置，生產工作人員也必須穿著連體防護服，以免受到二次汙染，製作過程極為嚴格。滅菌型口罩一般是在無塵車間生產的，要求沒有滅菌口罩那麼嚴格。
滅菌口罩的一般在醫院或者是一些流行性傳染病、疫情期間使用比較多，更加安全，而非滅菌口罩就是普通的防塵口罩，適合在工廠車間或者是霧霾、大風天氣配戴。各有各的用處以及優缺點，主要根據自身實際需求而定。無菌口罩和滅菌口罩哪個更好，主要是看生活中對於口罩的用途，一般要是在傳染病多發的環境或者季節，那麼使用滅菌口罩會比較好，尤其是在醫院或者處理傷口的時候使用滅菌口罩更合適。
但如果是霧霾天氣或者沙塵暴天氣以及其他氣象不佳時，只需對口鼻進行護理的話使用非滅菌口罩更好一些；但若是長時間需要對病毒、細菌進行阻隔，建議對於高危險暴露人群需要使用醫用防護口罩，較低風險暴露人員適合佩戴一次性醫用口罩或KN系列。但其實生活中無論是非滅菌醫用口罩還是滅菌醫用口罩均有防護功能，可阻隔飛沫，達到防止交叉感染的目的，並不能片面的說哪個好與不好，可根據自身需要進行選擇。
1、滅菌程度不同滅菌程度為一次性口罩滅菌與非滅菌的區別之一，雖然兩者是在無菌車間生產的，但是滅菌型口罩的滅菌程度和標準會遠遠大於非滅菌型，且生產滅菌口罩車間的無菌級別會高於非滅菌型。2、微生物指標不同一次性滅菌型口罩和非滅菌型口罩都屬於一次性醫用口罩，都是按照YY/T 0969的規定生產的，但是兩者對口罩的微生物指標也有所不同，滅菌型口罩要求無菌，而非滅菌型口罩只是對微生物有限度要求。
3、主要用途不同非滅菌一次性口罩通常指的是普通的防塵口罩，這種口罩在工廠車間使用的比較多，平時遇到霧霾天或大風天氣，也可以佩戴這種口罩進行防護，而滅菌口罩在醫院使用的比較多。
擴充套件資料滅菌型的是跟防毒面具差不多那種具有過濾毒氣細菌的, 而非滅菌的就是一般的防塵防霧霾口罩 4.非滅菌口罩，未經過環氧乙烷滅菌，生產出來以後無需3-14天的解析期，可以直接上市銷售。滅菌和非滅菌醫用口罩的微生物檢驗標準裡，非滅菌的一般細菌每克不超過100個。非滅菌型經環氧乙烷滅菌，也是可以起到一定的防護作用的。
口罩無菌和非無菌的區別是：1、口罩滅菌型和非滅菌型的區別主要在於是否用環氧乙烷滅菌。2、滅菌型口罩已經用環氧乙烷滅菌，口罩上面不存在有其他的細菌。
非滅菌型的口罩沒有用環氧乙烷滅菌，其上面可能還會存在其他型別的細菌，但是不會治病。
3、滅菌型口罩的滅菌程度和標準會遠遠大於非滅菌型,且生產滅菌口罩車間的無菌級別會高於非滅菌型。4、非滅菌一次性口罩通常指的是普通的防塵口罩，這種口罩在工廠車間使用的比較多，平時遇到霧霾天或大風天氣，也可以佩戴這種口罩進行防護，而滅菌口罩在醫院使用的比較多。5、滅菌型和非滅菌型的口罩都可以起到防護的作用。需要注意的是一定要在有效期內使用口罩。
如果口罩已經過期，是不能夠起到防護的作用的。暫時用口罩的時候一定要注意不能夠經常用手去觸控口罩，口罩需要定期更換，才能達到最佳的防護效果。戴口罩注意事項：1、先洗乾淨手再戴口罩，儘量避免用手接觸口罩內側，儘可能的把口罩被汙染的可能性降低。
2、不要戴錯正反，也不要兩面輪流戴，口罩要分清內外、上下，一次性醫用外科口罩，外面是深色的，裡面淺色的，有金屬條一端是上方。3、在佩戴口罩時要將折面完全展開，將口、鼻、下頜完全包住，儘量收緊口罩的鬆緊帶，壓緊鼻兩側的金屬條，以減少四周的洩漏，且最好緩慢呼吸。
口罩滅菌型和非滅菌型的區別主要是對口罩的微生物指標不同 、滅菌程度和標準不同、生產的週期不同、適用範圍不同、包裝不同、價格不同。1、對口罩的微生物指標不同滅菌型要求無菌（微生物不得檢出），非滅菌型雖然也是要進行消毒殺菌處理，但要求不得檢出致病菌，其檢測標準對微生物只有限度要求，無需達到無菌的指標。
2、滅菌程度和標準不同製作滅菌型的口罩車間一定要求10萬級淨化車間，也一定要終端消毒，都必須採用環氧乙烷或者射線消毒；而非滅菌型的只需要潔淨車間，但只建議用環氧乙烷消毒為妥。
3、生產的週期不同通過環氧乙烷滅菌的口罩，需要標註滅菌或無菌字樣，而經過滅菌後的口罩不能立刻上市銷售，需要7-14天的解析期，使環氧乙烷的殘留量降低到合格標準，這樣就會延緩生產的週期，因此生產一個滅菌型的口罩遠比非滅菌型口罩時間要長。4、適用範圍不同滅菌型口罩適用範圍更廣，不僅日常佩戴可滿足要求，而且在醫療環境中，如ICU、手術室等需要嚴格控制微生物環境的場所需要進入的東西都是無菌的，這樣才不至於引起患者的細菌感染，所以這些地方必須使用滅菌型口罩，而非滅菌型口罩則不適用。5、包裝不同滅菌型口罩由於滅菌要求高，一般口罩都是獨立包裝的，而非滅菌型口罩多是散裝的多，尤其是在目前口罩供需大量增長的時候，很多口罩都是批量散裝售賣，這類就是非滅菌型口罩，不過對於滅菌型口罩來說如果已經拆開包裝的話，它也就變成了非滅菌口罩了。6、價格不同無菌型口罩在的生產環境必須是無塵、無菌的，有特殊要求的口罩必須在指定恆溫恆溼環境條件下進行生產，從初始挑選原料到最終成型內包，全程都必須無塵、無菌化，其生產環境成本較高，售賣價格也會比非滅菌型口罩要貴一些。
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