孤府指的是

三焦。源於《靈樞營衛生會》上焦如霧，中焦如漚，下焦如瀆之論。三焦是分佈於胸腹腔的包容五臟六腑的一個大府，並因其大而成為孤府。

三焦，為六腑之一，是上、中、下三焦的合稱。三焦是中醫藏象學說中一個特有的名詞，六腑之一，位於軀體和臟腑之間的空腔，包含胸腔和腹腔，人體的其他臟腑器官均在其中，是上焦、中焦和下焦的合稱，即將軀幹劃分為3個部位，橫膈以上內臟器官為上焦，包括心、肺。

橫膈以下至臍內臟器官為中焦，包括脾、胃、肝、膽等內臟;臍以下內臟器官為下焦，包括腎、大腸、小腸、膀胱。以上焦、中焦、下焦三焦為綱，對溫病過程中的病理變化、證候特點及其傳變規律進行分析和概括，確立治療原則並藉以推測預後轉歸的辨證方法。