留駐南京：
1 文學院,理學院--南京大學
2 工學院部分院系--南京工學院--東南大學
3 工學院水利系--河海大學
4 工學院化工系--南京化工學院--南京化工大學--南京工業大學
5 師範學院--南京師範大學
6 農學院--南京農業大學
7 農學院林學系--南京林業大學
8 南京大學氣象工程系--南京氣象學院--南京資訊工程大學
外遷：
9 商學院--上海財經大學
10 工學院航空系--華東航空學院--西北工業大學 （西安）
11 醫學院--第五軍醫大學--第四軍醫大學
12 工學院食品工程系--無錫輕工業學院--無錫輕工業大學--江南大學 （無錫）
13 工學院農業機械系--江蘇工學院--江蘇理工大學--江蘇大學 （鎮江）
14 法學院--華東政法學院 --華東政法大學（上海）
15 中科院心理研究所
16 金陵大學影音部---中央電影學校---北京電影學院
17 中央大學醫學院－－上海醫學院－－上海醫科大學－－復旦大學醫學院
18 工學院電子工程系有線電部分－－成都電訊工程學院－－電子科技大學（成都）
19 國立中央大學音樂學院－－中央音樂學院
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