新疆大學、塔里木大學、新疆農業大學、石河子大學、新疆醫科大學、新疆師範大學等等。截至目前，新疆有新疆大學、塔里木大學、新疆農業大學、石河子大學、新疆醫科大學、新疆師範大學、喀什大學、伊犁師範大學、新疆財經大學、新疆藝術學院、新疆工程學院、昌吉學院、新疆警察學院、新疆理工學院、新疆第二醫學院等55所大學。
新疆大學(Xinjiang University)，簡稱新大，位於新疆維吾爾自治區首府烏魯木齊，是1978年確定的全國重點大學，國家"211工程"建設高校、國家西部大開發重點建設高校、中西部高校基礎能力建設工程高校、"、"卓越工程師教育培養計劃"、"卓越法律人才教育培養計劃"、教育部與新疆維吾爾自治區人民政府共建高校，"中西部高校聯盟"成員。
新疆大學前身是創辦於1924年的新疆俄文法政專門學校。1935年1月改建為新疆學院，1960年10月1日，正式成立新疆大學，1978年被國務院確定為新疆唯一的全國重點大學，1997年被列入國家"211工程"重點建設高校，2000年被確定為國家西部大開發重點建設高校。2000年12月30日，新疆大學與原新疆工學院合併組建新的新疆大學。2004年，學校成為新疆維吾爾自治區人民政府、教育部"區部共建"高校。
截至2014年6月，有各類在校生24800餘人，其中全日制普通本科生19400餘人，全日制碩士研究生3800餘人，全日制博士研究生近300人，非全日制專業學位研究生800餘人，留學生400餘人。塔里木大學原名塔里木農墾大學，位於新疆南部塔里木河畔的阿拉爾市。是中西部高等教育振興計劃高校，教育部實施援疆學科建設計劃;國家首批卓越農林人才教育培養計劃改革試點高校， 指定浙江大學、武漢大學、中國農業大學、東華大學、蘭州大學、華中農業大學、東北農業大學、北京化工大學等著名高校對口支援塔里木大學。
學校於1958年建立，是國務院學位委員會批准的首批具有學士學位授予權的本科院校，2003年獲得碩士學位授予權，2004年5月經教育部批准，更名為塔里木大學。原為農業部直屬高校，現為中央和新疆生產建設兵團共建。截止2015年12月，校園面積2570畝，校舍建築面積40萬平方米，各類在校生13000餘人，其中全日制普通本科生12800餘人，全日制碩士研究生300餘人。
新疆農業大學是自治區重點建設的一所農業高等院校，前身為新疆八一農學院，是經毛主席和中央軍委同意，由王震將軍於1952年建立的本科高校。1995年4月21日經原國家教委批准，更名為新疆農業大學。2006年本科教學工作水平評估優秀。
新疆農業大學是國家林業局與自治區人民政府共建高校;中西部高校基礎能力建設工程高校;國家"特色重點學科專案"高校;國家首批卓越農林人才教育培養計劃改革試點高校;卓越工程師教育培養計劃高校;"國家建設高水平大學公派研究生專案"入選高校。截至2013年，該校有17個學院，有各類在冊學生20000餘人，有教職工1500餘人。有6個博士後科研流動工作站、18個博士學位授權點、73個碩士學位授權點、4個專業學位碩士授權點 。石河子大學位於被譽為戈壁明珠的新疆石河子市，是國家 “211工程”重點大學，是“中西部高校綜合實力提升工程”（一省一校）高校和“中西部高校基礎能力建設工程”高校，入選“2011計劃”、"卓越醫生教育培養計劃"、"卓越工程師教育培養計劃"、"卓越農林人才教育培養計劃"，由教育部和新疆生產建設兵團共建，是國家西部重點建設十四所高校之一，“中西部高校聯盟”成員。
學校現有經濟、法、教育、文、歷史、理、工、農、醫、管理、藝術等11大學科門類。擁有5個一級學科博士學位授權點，涵蓋25個二級學科博士學位授權點；23個一級學科碩士學位授權點，144個相關二級學科碩士學位授權點；9種碩士專業學位授權類別，84個本科專業，4個博士後流動站（科研工作站）。 截至2015年3月5日，石河子大學校園面積182萬平方米，校舍面積117萬平方米，實驗室面積15萬平方米，綠化覆蓋率43%。圖書館館藏中、外文書刊300萬餘冊。
學校設有國家大學生文化素質教育基地、校外實踐教育基地。面向全國31個省（市、區）招生，現有在校生40185人，其中普通本專科生22576人，國防生485人，碩士、博士研究生3735人。學校本科畢業生就業率連續多年保持在90%以上。新疆醫科大學，坐落於新疆維吾爾自治區首府烏魯木齊市風景秀麗的鯉魚山下，是一所具有光榮傳統的省屬重點大學，入選"卓越醫生教育培養計劃"，是國家衛生部和新疆自治區共建高校。
其前身新疆醫學院始建於1954年，1956年建成招生，1998年6月新疆醫學院與新疆中醫學院合併成立了新疆醫科大學，2011年11月4日，國家衛生部與新疆自治區簽署了共建該校的協議。截止2014年2月，學校有4個校區，佔地面積130.2萬餘平方米(13020畝)，建築面積61.59萬平方米(含六所附屬醫院)，教學、醫療、科研裝置總價值49.54億元(含六所附屬醫院)，藏書40.8萬冊;下設14個學院，2個教學部;各類在校生26770餘人，其中博士研究生430人，碩士研究生3043人，普通本科生7919人，普通專科生3002人，留學生606人，成人教育學生7804人，獨立學院學生3612人。新疆師範大學創立於1978年12月，其前身是烏魯木齊市第一師範學校和新疆教師培訓部。
是"中西部高校基礎能力建設工程高校"之一。截至2013年，學校有22個學院，有56個本科招生專業、34個專科專業，覆蓋了經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、管理學8個學科門類，擁有2個自治區重點學科，1個自治區重點實驗室、11個校級優先發展學科、5個校級人文社會科學重點研究基地、4個校級重點實驗室。學校先後榮獲全國先進基層黨總支、全國民族團結進步先進集體、自治區先進基層黨組織、開發建設新疆先進集體、自治區文明單位等榮譽稱號。
學校位於烏魯木齊市，由校本部、文光校區和幸福路校區三個校區組成。
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