申萬巨集源的手續費包括佣金、過戶費以及印花稅。佣金一般按成交金額的0.2%-0.3%收取,因證券公司不同而有所浮動。起點為5元,買賣雙向收取;過戶費僅限於滬市,每1000股收取1元,低於1000股也收取1元。印花稅按交易金額的0.1%收取,單邊收取。