植物的三套密碼中包括

植物的三套密碼中包括光合作用、次生代謝。主要作用植物大多數固態物質是從大氣層中取得。經由一個被稱為光合作用的過程，植物利用陽光裡的能源來將大氣層中的二氧化碳轉化成簡單的糖。這些糖分被用作建材，並構成植物主要結構成份。植物主要依靠土壤作為支撐和取得水份，以及氮、磷等重要基本養分。

大部分植物要能成功地成長，也需要大氣中的氧氣（作為呼吸之用）及根部周圍的氧氣。不過，一些特殊維管植物如紅樹林可以讓其根部在缺氧環境下成長。

光合作用，光合作用植物具有光合作用的能力——就是說它可以藉助光能及動物體內所不具備的葉綠素，利用水、無機鹽和二氧化碳進行光合作用，釋放氧氣，產生葡萄糖——含有豐富能量的物質，供植物體利用。