1、如果公積金貸款申請人未能按照公積金借款合同每月履行還款義務，公積金管理中心可根據相關規定對貸款申請人的逾期部分房貸進行罰息。
2、如果公積金貸款申請人在經多次催收後，仍無力進行還款的，公積金管理中心可以向法院申請處理公積金貸款申請人的抵押物或質押物。
3、公積金貸款申請人本人及配偶的逾期記錄將會被公積金管理中心上報個人徵信中心。同時，其貸款擔保人也會需要負一定的法律連帶責任。
1、等額本金或者等額本息還款方式
（1、在合同約定的還款日償還逾期的貸款，中心將借款人逾期總額以及當月應還款額在合同約定還款日的前一個工作日，向銀行一併通知並由銀行進行扣劃。需要注意的是逾期貸款借款人合同約定還款日，或還款期的前三個工作日與後三個工作日不進行非合同約定還款日的逾期扣劃。
（2、超出合同約定的還款日償還逾期的貸款，中心於每週三的前一個工作日將逾期貸款資料傳輸給銀行，要求銀行於週三對逾期貸款借款人存入還款賬戶的資金進行扣劃。對於元旦、春節、五一、十一等長假，在節假日期間及節後第一個工作日如遇週三，不做非合同約定還款日的逾期扣劃。
2、如果是自由還款方式下產生逾期
（1、如果借款人是在合同約定的還款日內，進行償還逾期的個人貸款，可以先通過銀行的呼叫銀行中心電話委託系統查詢到下一還款日至少應該償還的貸款金額。查詢出來的金額為逾期貸款的本息、罰息與低還款額的總和。
借款人若在下一還款日按照這個數額還款，那麼便不再逾期。也可以到貸款業務部門簽訂“借款人調整月還款額通知書”確定下一還款日的還款額。這兩種方式都是可以查詢到需要逾期還款的日期和金額的。
（2、如果借款人不是在合同約定的還款日，進行償還逾期的個人貸款。需要借貸人攜帶本人身份證原價到貸款業務部門辦理相關的手續才可以進行逾期還款。
借款人首先要先貸款業務部門提出申請，然後兩者協商約定一個還款日，通常約定還款日的範圍是這樣確定的：
借款人到管理部辦理還款手續的三天後至下一個合同約定還款日之前，但借款人每期只能到櫃檯辦理一次非合同約定還款日逾期個人貸款償還手續，借款人還需要在還款日的七個工作日前辦理。
並且借貸人需要填寫一份“償還逾期個人住房擔保責任委託貸款承諾書”，這個承諾書需要一式兩份，本人和所貸款的銀行各持一份。
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