廣州中醫藥大學開設的專業有中西醫臨床醫學、鍼灸推拿學、康復治療學、中藥學、中藥資源與開發、藥學、製藥工程、藥物製劑、中藥製藥等。
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| 學院名稱 | 專業設定 |
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| 基礎醫學院 | 中醫學（九年制）、中醫學（“5+3”一體化）下、中醫學（“5+3”一體化）、中醫學（中醫骨傷科臨床方向） |
| 鍼灸康復臨床醫學院 | 中西醫臨床醫學、鍼灸推拿學、康復治療學 |
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| 中藥學院 | 中藥學、中藥資源與開發、藥學、製藥工程、藥物製劑、中藥製藥 |
| 外國語學院 | 英語 |
| 經濟與管理學院 | 國際經濟與貿易、公共事業管理、保險學、市場營銷、應用心理學 |
| 護理學院 | 護理學 |
| 體育健康學院 | 體育教育 |
| 醫學資訊工程學院 | 電腦科學與技術、醫學資訊工程 、醫學檢驗技術、生物技術 |
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