南京航空航天大學設有飛行器設計與工程，飛行器環境與生命保障工程，建築環境與能源應用工程，飛行器動力工程，探測制導與控制技術，微電子科學與工程等專業。
南京航空航天大學專業名單
| 學院 | 專業名稱 | 可以培養層次 | ||||
| 學士 | 碩士 | 博士 | 博士後 | |||
| 航空學院 | 飛行器設計與工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 飛行器環境與生命保障工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 建築環境與能源應用工程 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 工程力學 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 能源與動力學院 | 飛行器動力工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 能源與動力工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 車輛工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 自動化學院 | 自動化 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 電氣工程及其自動化 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 測控技術與儀器 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 生物醫學工程 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 探測制導與控制技術 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 電子資訊工程學院 | 電子資訊類 | 電子資訊科學與技術 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ |
| 電子資訊科學與技術（微波毫米波系統與器件技術） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 資訊工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 微電子科學與工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 機電學院 | 機械工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 工業設計 | ☆ | ☆ | ||||
| 飛行器製造工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 飛行器製造工程（航空維修工程與技術） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 材料科學與技術學院 | 材料科學與工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 應用化學 | ☆ | ☆ | ||||
| 核工程類 | 核工程與核技術 | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 輻射防護與核安全 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 新能源材料與器件 | ☆ | ☆ | ||||
| 民航/飛行學院 | 交通運輸（空中交通管制與籤派） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 交通運輸（民航運輸管理） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 交通運輸（民航機務工程） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 交通運輸（民航電子電氣工程） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 交通運輸（機場執行與管理） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 土木工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 飛行器適航技術 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 飛行技術 | ☆ | |||||
| 理學院 | 資訊與計算科學 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 應用物理學 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 應用統計學 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 經濟與管理學院 | 管理科學與工程類 | 資訊管理與資訊系統 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ |
| 工業工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 經濟與貿易類 | 國際經濟與貿易 | ☆ | ☆ | |||
| 金融學 | ☆ | ☆ | ||||
| 工商管理類 | 工商管理 | ☆ | ☆ | |||
| 會計學 | ☆ | ☆ | ||||
| 人文與社會科學學院 | 法學 | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 政治學與行政學 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 公共事業管理 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 藝術學院 | 廣播電視學 | ☆ | ☆ | |||
| 音樂表演 | ☆ | ☆ | ||||
| 戲劇影視美術設計 | ☆ | ☆ | ||||
| 環境設計 | ☆ | ☆ | ||||
| 外國語學院 | 英語（民航業務、國際貿易） | ☆ | ☆ | |||
| 日語 | ☆ | ☆ | ||||
| 航天學院 | 飛行器控制與資訊工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 航空航天工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 光電資訊科學與工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 電腦科學與技術學院 | 電腦科學與技術 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 資訊保安 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 軟體工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 物聯網工程 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 長空學院 | 航空航天類（飛行器設計與工程、飛行器環境與生命保障工程、飛行器動力工程、飛行器製造工程、飛行器製造工程（航空維修工程與技術）） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 國際教育學院 | 自動化（航空電子與控制）（中外合作辦學） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 交通運輸（機場執行與管理）（中外合作辦學） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
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